La UFG pertenece a las siguientes asociaciones:
- Asociación de Universidades Privadas de El Salvador (AUPRIDES).
- Asociación de Universidades Privadas de Centroamérica y Panamá (AUPRICA).
- Grupo de Universidades Iberoamericanas La Rábida.
- Redes Temáticas del Programa Iberoamericano de Ciencia y Tecnología para el Desarrollo (CYTED).
- Agencia Centroamericana de Acreditación de Programas de Arquitectura e Ingeniería (ACAAI).
- Red Latinoamericana de Universidades por la Calidad y el Desarrollo Sostenible, dirigida por el Instituto Centroamericano de Administración de Empresas (INCAE).
- Confederación Panamericana de Escuelas de Hostelería, Gastronomía y Turismo (CONPETH).
- Red Avanzada de Investigación, Ciencia y Educación Salvadoreña (RAICES).
- Red de Instituciones del Programa First Tuesday El Salvador, patrocinado por PROINNOVA, FUSADES.
- Miembro Titular de la Unión de Universidades de América Latina y el Caribe (UDUAL).
- Red Emprende, Formada por Instituciones que promueven y apoyan el Emprendimiento en El Salvador (Red Apoyada por CONAMYPE y el Programa CEMPROMYPE de la Secretaria de Integración Centroamericana—SICA).
- Red de Incubadoras Latinoamericanas Apoyadas por el Programa INFODEV del Banco Mundial (REDLAC).